Boas
Para começar era mlehor que pudesses ter um pouco mais de largura que os 25cm, ia ajudar-te muito no layout.
Para saberes as medidas, espessuras etc nada melhor que ires ao http://www.theaquatools.com/ e experimentares.
Relativamente ao silicone compra específico para aquario (ou seja 100% silicone, sem anti-bolor).
Quanto ao filtro e termostato vai de cada um e da carteira. O filtro deve ter um caudal entre 3-5 vezes o volume do aquario e com um termostato de 150-200w fazes a festa.