olá sergio!
mesmo sabendo que cada aquário é um caso, eu arriscaria já dizer que o principal problema poderá ser uma iluminação deficiente... nem todas as plantas que tens sobrevivem com pouca luz e se as folhas estão a apodrecer, aconselho-te já a parares com as fertilizações, pois só estás a acumular nutrientes que não estao a ser absorvidos e não tarda nada vais ter uma explosão de algas no aquário todo!
li no teu setup 'água de nascente'... foi com isso que encheste o aquário e que fazes as tpas? se sim, pára já e usa água da torneira, pois a primeira contem pouquíssimos minerais, que são essenciais para o desenvolvimento da flora...
o facto da lã de vidro estar imunda, é natural; o que não é, é a água não estar cristalina.... qual a potência desse filtro?
conselho: remove todas as folhas velhas, aspira bem o substrato, faz uma limpeza no filtro e uma tpa generosa com água 'del cano' (isto para não falar noutra calha, claro... ).
boa sorte