Olá viva. Antes de mais creio que podemos todos usar o termo certo para a coisa, não estás a injectar O2, mas sim ar, ou seja estás a catalizar as trocas gasosas entre a água e o ar que a única coisa que fazem é forçar as concentrações de gases presentes na água ao seu estado de equilíbrio.
Num aquário à antiga, ou num aquário de criação, ou como disse o dfelix, num aquário de ciclídeos africanos, com mais peixes que plantas, há uma tendência para as concentrações de CO2 e O2 na água subirem e descerem respectivamente. Nestes casos injectar ar diminui o CO2 em excesso e repõe o O2 em falta.
Num aquário plantado sem peixes (com muito e rápido crescimento vegetal) há um tendência para as concentrações de CO2 e O2 na água descerem e subirem respectivamente (o oposto do caso anterior). Nestes casos injectar ar aumenta o CO2 e diminui o O2.
No teu caso particular o que deves fazer é: durante o dia injectar CO2, mas somente aquele que vai ser absorvido e transformado em oxigénio pelas plantas, se o conseguires o resultado é uma água rica tanto em CO2 como em O2, ou seja boa tanto para peixes como para plantas onde não te interessa mexer. De noite o teu aquário comporta-se como o primeiro caso, cheio de organismos a respirar (peixes + plantas) e é nesse periodo que deves ligar a injecção de ar para amainar os excessos.
Espero ter ajudado,
Um abraço,
Pedro