Se bem percebo as que queres passar por água da torneira são as novas, certo? Fazes bem, há pelo menos uma boa marca que o recomenda.
Quanto ao "estágio" dessas cerâmicas em água de aquário, pouco vai fazer, mas mal também não faz. (não faças, perda de tempo, tem mais cuidado com o passo seguinte).
A substituição das cerâmicas velhas deve ser feita gradualmente.
Eu cá faria isso ao longo de 1 mês, com substituição de 1/3 de cada vez 1/3 no dia 0, 1/3 15 dias depois e o resto 15 dias depois.
É que se substituis tudo de uma vez estás a colocar cerâmicas sem bactérias (praticamente não há filtro biológico). Há ainda a agravante de demorarem a colonizar.
No procedimento que te indiquei, não anulas o filtro pois mantens sempre algumas cerâmicas colonizadas e dás tempo para que ocorra a colonização das novas.
Nesta fase aconselho maior cuidado com as TPA´s e comida a dar aos peixes (o mínimo possível) porque o filtro que já não devia estar grande coisa (por isso estás a mudar, certo) vai ficar um pouco pior (enquanto não voltar a estabilizar)
Cumps