Boas, se forem xistos, não há problema, tal como os basaltos. Este tipo de rochas não vai alterar o pH do teu aqua, que é a principal preocupação a ter quando escolhes uma rocha.
Depois disto, há rochas do tipo calcário, e outras, que possuem calcite, e que vão alterar o pH do aqua, tornando-o mais ácido.
O tratamento a dares à rocha, é lavares bem, remover todo o tipo de sujidade visível, depois uns 15 minutos mergulhada em água a ferver, e está pronta para colocar no aqua.
Por norma, todas as rochas apanhadas em cursos de água são boas para colocar no aqua, mas só para ter a certeza coloca uma foto da dita, que logo te esclarecemos melhor.