Boas,
Antes de mais o aqua que tens penso ser demasiado pequeno para as 3 corydoras, ja agora o que tens dentro do aquario?
Ao efectuares a troca do material filtrante estas a retirar toda a colonia nitrificante do filtro dai poderes ter picos de amonia.
Testes nao tens? Seria mais facil se pusesses os parametros da agua.
Essa camada gordurosa na superficie deve-se a falta de movimentaçao da agua na superficie
Poe uma foto do aquario e das corydoras que sempre ajuda mais qualquer coisa
Por fim mas nao menos importante as corydoras sao peixes de cardume em que no minimo deve-se ter 4 mas preferencialmente de 6 para cima, mas no teu caso nem 3 devias ter.
PS: Falo por experiencia Teorica