Directamente não...
Excesso de nitrato pode levar a outros problemas (irritação "na pele", problemas respiratórios, etc). O valor de nitratos não deve ser muito elevado nem os peixes devem estar muito tempo em água com nitratos elevados.
O que pode acontecer é, devido a isso, o peixe "não se sentir bem no aquário", fica mais fragilizado e, aí sim, as bactérias podem atacar (estamos a falar em níveis elevados de nitratos).
Para removeres os nitratos tens de fazer trocas de água.
O mais comum é a má qualidade da água e alimentação incorrecta ou pouco variada.
Normalmente as doenças bacterianas aparecem e atacam os peixes mais fragilizados.