Boas Zogli
Lamento mas não dará para colocar qualquer capa protectora, essa iria apenas acelerar a decomposição da madeira visto ser velha e estar já sob o efeito da água.
Os normais vernizes não podem ser utilizados, temo que a parafina tenha igualmente um efeito prejudicial para o aqua. A utilização de resinas é por mim desaconselhada tendo em vista o periodo de gestação de insectos xilófagos possivelmente existentes que poderão resistir alguns anos até eventualmente perfurarem a protecção ou revestimento.
O meu conselho é que te dirijas à Fundação Ricardo Espirito Santo que tem uma secção especifica de restauro de peças em madeira e de estudos especificos nessa área e perguntes qual a melhor forma de tratar a madeira em questão para a poderes colocar num aquário e que produtos devas utilizar (leva uma amostra da madeira em questão)
Outra opção é continuares a ferver ininterruptamente até que todos os taninos saiam da madeira.
Se for madeira muito velha e se tiver sido utilizada em construção tem de certeza anilinas (corantes) adicionados com verniz celulósico ou óleo de linhaça, que embora não se possa, aparentemente, ver possam provocar esse excesso de coloração e sejam igualmente fatais num aqua.
Posso efectuar um estudo e verificar/identificar a madeira em questão se me puderes enviar uma pequena amostra (efectivamente pequena apenas para testes), de facto são optimas para um layout, temo é que não as consigas usar pelas razões que enumeraste.
Outro factor em consideração é o estado presente de decomposição das mesmas, tinham alguns insectos xilofagos antes do tratamento? tais como o comum caruncho ?
Se de facto tinha, ficas desde já a saber que o 'caruncho' não é mais que um 'agricultor' que cuida nas inúmeras galerias de 'plantações' de fungos para degradação da celulose da qual se alimenta. Se este for igualmente o caso podes ter mais outro problema para resolver que será resolvido com muitas fervuras com sal!
Abraço
JT