Pode não ser problemas com a água...
Aqui à uns meses saiu um artigo interessante na revista Aquamania sobre "Discus e Formol", o uso para combater parasitas (dactylogyrus) e como estes afectavam os discus recém nascidos.
Podes recorrer ao Praziquantel ou à Formalina para tratamento.
Os parasitas eram introduzidos no aquário pelos "pais" sendo que os recém-nascidos eram bastante afectados por isso.
Esse respirar rápido pode indicar problemas com parasitas, bem como, abertura em demasia dos opérculos, escurecimento, o roçar em objectos, falta de apetite, etc.
Posso-te enviar o artigo por mail se quiseres...
Um abraço.