Esse filtro incorporado a que te referes deve ser biobox não?
Se for, provavelmente eles ficaram presos na esponja ou na lã, também já me aconteceu.
Fazes assim: pegas num balde, enches o balde com água do aqua, tiras a esponja onde ficaram presos para o balde e abana-la.
Eles assim devem sair.
cumps