Olá Emen.
Muito bonito. Um clássico muito elegante... Eu, que já sou bem crescido, adoro ver um aquário assim!
Tens uma montagem com 2 anos, pelo que já está bem madura, contudo esses picos de nitritos e nitratos são estranhos. Sobretudo os nitritos! Supostamente tens poucas plantas para os consumir, mas como tens as flutuantes, elas também dão uma ajuda e com cerca de 8 vezes de renovação da bomba relativamente ao volume total, deveria ser suficiente.
Os outros parâmetros da água estão dentro dos valores normais?
Tens a certeza que ainda aí estão os 20 sweglesi? Podes ter perdido algum(s) e não tenhas visto o corpito em decomposição...
Tens feito a manutenção do filtro? Efetivamente só pode estar bem maduro, mas talvez já não esteja tão eficiente como deveria (os ciclídeos gostam de água muito limpa). Ao fim de 2 anos talvez devesses pensar em substituir, aos poucos, a média filtrante. Mesmo as mais eficientes vão ficando com as porosidades entupidas, perdendo parte da capacidade de alojamento das bactérias. Umas mais rapidamente que outras, mas nenhuma é eterna (talvez isto não se aplique ao K1, mas nunca usei, desconheço). Se fossem outro tipo de peixes, não deverias estar a dar por isso, mas os ciclídeos, como sabes, são particularmente sensíveis (embora os Escalares até nem sejam dos piores).
Supostamente ao fim de dois anos tens bastante matéria orgânica acumulada no substrato, embora pelas fotos a areia pareça relativamente limpa, ou será apenas à superfície? Embora o próprio substrato deva ter bastantes bactérias para efetuar a desnitrificação, elas não consomem os nitratos (isso só com plantas ou TPA's). Contudo como tens aí um pico de nitritos, algo não está a funcionar a 100%.
Poderá ser algo que não me ocorra, mas o mais sensato será ir descartando as hipóteses, uma a uma.
Não entres em desespero que com calma e método, isso deverá ir ao lugar. A montagem é linda... Parabéns!