Bem, eu não tenho assim grande experiência nisto, já que começei neste hobby há pouco tempo.
Mas vou partilhar umas ideias minhas, cabendo-te a ti considerá-las eventualmente plausíveis ou não.
Com o passar do tempo o meio ambiente de um aquário vai ficando mais ácido, mas tal é gradual.
Acho que mesmo que a curva da acidez seja mais acentuada para o final, não há movimentos bruscos como o mencionado.
Uma contaminação da coluna de água pelo substrato fértil poderia causar aumento da acidez, acho.
Observa de o fértil continua bem isolado.
O carvão activo absorve sté um certo limite, e não sabendo o logística a quantidade de químicos a que vais sujeitar o carvão, não pode na minha opinião estipular um prazo tão longo.
É importante frisar que quando saturado, p carvão começa a libertar os químicos absorvidos.
Agora se liberta devagar ou depressa...não sei.
O caso do teu aquário pode ser talvez como aqueles pneus recauchutados. Quanto rebentam não é devagar, é de uma vez.
Vamos ver se há pessoal com mais ideias.