Bem ... eu sou químico e trabalhei alguns anos com culturas de bactérias, quando recebiamos um novo reator(Dorna ... tipo um balde onde ficam as culturas de bactérias) haviam valvulas e bombas que eram coladas ao sistema ... bem mas vou chegar na parte que tem haver com teu aquario agora ... colocavamos ele para rodar (como um aquario a ciclar) só com água para que as substâncias tóxicas para as bactérias se diluíssem na água, que era trocada várias vezes durante períodos que podiam chegar a semanas até que em testes de laboratórios não detectássemos mais a presença de tais substâncias.
Acho que o masmo ocorre em aquários tudo que já tinha de tóxico no silicone já passou pra água durante os anos que ficou com seu antigo dono. Acho que mexer agora talvez seja mais prejudicial para o aquário pois pode expor partes do silicone cujas subtâncias tóxicas ainda não foram solubilizadas. Ná fabrica onde trabalhei tínhamos sérios problemas quando precisávamos substituir uma válvula (era uma indústria de alimentos) pois as borrachas de vedação, colas, encanamentos por vezes calsavam alterações no sabor... pois liberavam substâncias no produto.
Resumindo ... a menos que teu aquário esteja vazando ... acho que não deves mexer nele .
Esta é minha opinião.
Espero ter ajudado