Olá Filipa,
Aconteceu-me o mesmo há umas duas semanas atrás, após ter colocado cenoura e ervilhas para os meus bótias. Coincidência ou não ainda estou para saber!! O que fiz foi TPA de 20% mas não resultou. No dia seguinte fiz limpeza TOTAL do filtro (o meu é interno), e da água/areão com aspirador, e mais um TPA de 20% e consegui que a água voltasse ao normal.
Já agora faz também testes de pH, No2, No3 e NH4, para teres a certeza que está tudo bem.
Se puderes coloca aí a tua "configuração" do aquário (peixes, plantas e demais), para os "gurus" deste fórum te ajudarem mais facilmente, pois eu sou novato nestas andanças.
Um abraço
Eduardo