Gonçalo não podes comparar os dois pois a proporção de substrato não é a mesma.
Acredito que as durezas da água tenham baixado sim, pois tens muito mais substrato neste aquário.
Isso foi a transição de emerso para submerso, nada mais. Não é assim tão pouco frequente.
Se na fase inicial tiver havido descidas das durezas e consequente ph pode ter causado isso, normalmente ao fim de 4 ou 5 semanas a coisa estabiliza, dependendo da agua que la se mete.
Cumprimentos