Olá,
Precisas de dar informação sobre o teu aquário, nomeadamente sobre dos seus parâmetros. De todos eles, o mais importante agora seria o valor de ph e de kh (dureza da agua ou o valor de carbonatos). Este ultimo parâmetro dá-te um ideia da capacidade de mudança de ph. Ou seja, os carbonatos funcionam como um tampão. Quanto mais alto for, menor será a variação de ph (perante situações que com o valor de kh baixo fariam variar de imediato do ph). Pelo que percebi o teu aquário tem como substrato um areao e não tem plantas vivas. Se assim fosse terias mais parâmetros para controlar e o ph seria mais um, mas importante. Mas mesmo assim podes controlar o valor de ph com a solução tampão que se contra nas lojas. Podes comprar quer para subir, quer para descer. Tudo depende da tua situação.
Outra coisa, confesso que nao entendo a ideia de desmanchar o aquário um vez por ano. O aquário nao e como uma casa em que se faz uma grande limpeza na primavera. Desiste do filtro de fundo e fica apenas com o outro. Se puderes investe em substracto e plantas compatíveis com os teus peixes.
Boa sorte