Não tem de ser assim, tens plantas que se dão bem sem substrato e de fácil/média manutenção, tipo anubias, etc, procura no forúm quais são e como se colocam, só tem de ter luz apropriada e fertilizante liquido.
E sim, podes desmanchar aqua, passa tudo para recipiente que suporte a água toda ou parcial, aproveitas e fazes TPA e reformula o aqua.