Eu fiz num comunitário, mas tenho uma vantagem 2 filtros.
Retirei um filtro, e ao outro mantive-o a bombear água para o aquário, mas retirei-lhe todas as matérias filtrantes, usei o filtro apenas como bomba de circulação.
O outro filtro, enchi um alguidar com água do aquário e criei um mini-sistema ali, meti tb dentro do alguidar as matérias filtrantes do outro que ficou vazio, assim mantive o ciclo sem problemas.
Confesso que tb fiquei preocupado, manter um aquário sem matérias filtrantes, e andei muito atento. Mas correu bem e não houve problemas nenhuns