Tenho lido um pouco deste tópico e tenho o mesmo problema. Na loja de aquariofilia onde vou, disseram que, que uma vez instalado, só com esterilização UV é que resolve. Podemos baixar os nitratos e fosfatos e pouca luz mas depois volta ao mesmo.  
Setup: 
Aqua de 150 litros (100X30X50) 
Dois goldfishs, um tronco, duas anúbias nana 
Filtro externo JBL e900 (debita 900l/h) e Esterilizador UVC JBL 5 W. 
Com a pressa de colocar o UV, devia ter feito outras coisas antes: TPA, limpeza de filtro, que não fiz. Mas também quero ver se realmente vai matar estas micro-algas nesta quantidade, porque o aqua está mesmo turvo (quase que não vejo o tronco). 
Iniciei nesta sexta dia 13 e nada atá agora. Na caixa recomendam que o aqua tenha um debito de 100 l/h. A ideia deve ser: com circulação mais lenta, a água passa mais devagar na luz UV e o efeito é maior  . 
Vou dando notícias...