Ola =)
Se sao larvas podem ser larvas de mosquito .Tente verificar os parâmetros da água pois os mosquitos depositam os seus ovos ,consequentemente larvas, em águas em que as condiçoes não andam muito boas ( pode ser da água directa da torneira por exemplo).
De qualquer maneira os peixes médios e grandes comem larvas de mosquito e daí pode ser que essa sua praga se evapore . No entanto visto que ainda nao tem ciclagem realizada para por peixinhos pode apanhá-los com uma rede e nao se preocupe com uma futura proliferaçao pois , os mosquitinhos ainda são demasiado novinhos para se reproduzirem.
Outra táctica é fechar a janela! Abrir a tampa do aqua para os mosquitos quando atingirem a maturidade sairem.
Mas claro isto se forem larvas de mosquito , acho improvavel serem de moscas.
Espero ter ajudado,
Beijo (=