Olá André
Teoricamente deves limpar o filtro externo de 2 em 2 ou 3 em 3 meses no entanto tudo depende da quantidade de fauna que "albergas" ou da necessidade.
Pessoalmente eu nao deixo passar os tres meses mas se o fluxo de saida de agua diminuir faço a limpeza antes(Inclui tubagens se necessitarem claro, devido ao depósito de Algas nas tubagens).
Agora se fazes a limpeza convem fazeres com agua que retiras do aqua, isso evita que as bactérias que estão alojadas nas massas filtrantes morram mas mais uma vez isto é teoricamente(eu faço)(aqua 180Lt).Se tiveres um aqua com +-300Lt podes passar agua da torneira no filtro, essas bacterias morrem mas existem mais umas milhoes no areão.
Espero ter ajudado, mas na multidão de conselhos está a sabedoria!