Pelo que eu tenho lido aqui pelo fórum, se for um aquário relativamente pequeno talvez não compense construir. São aquários construídos em série e por isso o preço comercial nas lojas fica em conta.
Se a opção acabar por ser a construção, então o conselho é ler muito. Surgem sempre imprevistos e quanto mais se ler, melhor os contornamos quando nos deparamos com eles. Eu já ando a ler há algum tempo e ainda não me sinto preparado para montar um aquário maior.
Grandes superfícies de bricolage como o AKI, Mestre Maco, Maxmat costumam ter silicones apropriados para aquários. Basta ter atenção às embalagens e ter a certeza do que se compra.
Cumprimentos
Pedro Pato Martins