Boas Nuno,
Cuidado com essas algas (eu penso que essas coisas pertencem à família dos fungos), pois se tiveres peixes, elas podem-se agarrar a eles e podem leva-los à morte. Tenta fazer + TPA´s e mete uma quantidade muito reduzida de sal.
Outra opção é arranjares azul de metileno.
Até posso arriscar que isso aparece porque o teu aqua/filtro ainda não está ciclado a 100%.
Ao que parece essa porcaria desenvolve-se bem quando ha problemas com os seguintes parâmetros: NO3, PO4 e KH
Espero ter ajudado,
Um abraço