Calma Paulo.
As bactérias que fazem desnitrificação não são todas iguais, ainda assim grande parte das mesmas são aeróbicas.(nitrosomas, nitrobacter, nitrospira sp etc) Existem outras que não necessitam de O2 (ou menos O2) e também fazem a OXIDAÇÂO por outro meio metabólico caso das aeromonas hydrophila por ex. entre outras pseudomas etc.
A questão passa pelo tipo e quantidade...
Ainda assim, e como bem escreves o que acontece por exemplo ao Ph em circuito fechado (agua residual do filtro) onde existem milhões e seres a respirar O2 e a libertar CO2? Pensa nisso, sem qualquer tipo de dogmas.
Depois dessa consequência ainda achas que não morrem com o que o que escreves?
Outra coisa que li, algo como "Dentro do aquario com agua a rolar num circuito fechado não há CO2 e a menos que injectes é zero". Não, isto não é verdade, se o fosse não havia plantas aquaticas que não fizessem descalcificação endógena, nem as conseguiríamos ter em aquários onde não houvesse CO2 injectado. Para senso comum o valor normal são 8ppm a 25ºC.
Sem dogmas, de uma perspectiva ou de outra. Força nisso!
As algas... eu não teria 50ppm de NO3 numa montagem com 2 semanas, mas lá está, sou eu.
cpts