Boas,
Já estive na mesma situação e acabei por desistir das tilápias, para o nosso clima não dá para termos tilápias na aquaponia. Mas se for pesquisar na net, principalmente em inglês encontra em vários sítios uma lista de peixes indicados para a aquaponia sem ser a tilápia, como por exemplo os peixes comuns laranjas ou as carpas koi.
Um conselho: Não dê prioridade aos peixes para começar o projeto, conheço alguns casos aqui em Portugal de pessoas com sistemas aquapônicos que não têm tilápias, e têm muito sucesso.
Espero ter ajudado, e boa sorte
Cumps.